El famoso Cristo de la Luz, obra culmen de Fernández perteneciente a los fondos del Museo Nacional de Escultura aunque depositada desde 1940 en la Universidad de Valladolid (Capilla Universitaria del Palacio de Santa Cruz) por el uso procesional de la talla en la actualidad como titular de la Hermandad Universitaria del Santísimo Cristo de la Luz, constituye una de las más conmovedoras versiones de la Crucifixión de toda la escultura española.

Realizado en origen para el monasterio vallisoletano de San Benito el Real, en una fecha cercana a 1630, dentro ya de del periodo final del escultor, su rostro afilado concuerda con un cuerpo consumido por el martirio y un paño de pureza duro y quebrado, como impulsado por el viento de la tempestad que se desató en el instante en el que Cristo expiró, todo ello reforzado con el gran patetismo que incorpora la policromía.

Esta escultura en madera (190 x 163 x 44 cm) se complementa con diversos materiales, buscando siempre Fernández su novedoso efecto naturalista. De este modo, los ojos son de cristal, los dientes de marfil, el corcho se utiliza para las llagas de las rodillas o el hombro, y unos elementos metálicos terminados en punta reproducen sendas espinas de la corona que atraviesan la ceja y oreja izquierdas, con lo que además se acrecienta el dramatismo del rostro.